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食品和營養(yǎng)
食品中的營養(yǎng)成分是蛋白質(zhì)、氨基酸、糖類、油和脂肪、維生素、食用色素等。與食品和營養(yǎng)有害的物質(zhì)則有殘留農(nóng)藥、致癌的曲黃霉素等。這些成分都可用薄層色譜法定性和定量。蛋白質(zhì)和多肽水解為氨基酸，對不同來源的動物性和植物性蛋白水解后產(chǎn)生不同的氨基酸進(jìn)行定性和定量，有助于解決蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和食品營養(yǎng)問題。二十多種氨基酸用硅膠G薄層板雙向展開，一次即能分開，然后定性和定量，方法快速而簡便。多糖和寡糖可水解為單糖，可用薄層色譜法進(jìn)行單糖和雙糖的定性和定量。文獻(xiàn)上有每一個糖的Rf值和相應(yīng)的展開劑。油和脂肪解為脂肪酸，脂肪酸的種類和結(jié)構(gòu)中的不飽和鍵數(shù)，與營養(yǎng)和衛(wèi)生有關(guān)，關(guān)于油和脂肪的薄層(硅膠、硅藻土、纖維素)分析，文獻(xiàn)和綜述很多。脂溶性和水溶性維生素在薄層上可方便地定性和定量，例如脂溶性維生素A,D,E,K及B2,B6,B12,酶酸，泛酸，葉酸，C,促生素在硅膠G薄層上可用苯：甲醇：丙酮：冰醋酸(7:2:0.5:0.5)分開。用硅膠G薄層和丙酮：CHCl3(1:1)以及激發(fā)波長365nm和波長450nm,可用熒光法測定ng量的曲黃素B1,B2,G1,G2,法靈敏快速。
藥物和藥物代謝
薄層色譜法在合成藥物和天然藥物中的應(yīng)用很廣。有些文獻(xiàn)和內(nèi)容偏重于合成藥物、化合物及其代謝產(chǎn)物，有文獻(xiàn)為在中草藥分析中的應(yīng)用。每一類藥物，例如磺胺、巴比妥、苯駢噻嗪、甾體激素、抗菌素、生物堿、強(qiáng)心甙、黃酮、揮發(fā)油和萜等，都包括幾種或十幾種化學(xué)結(jié)構(gòu)和性質(zhì)非常相似的化合物，可以在上述文獻(xiàn)中找出一、二種全盤的展開劑，一次即能把每一類的多種化合物很好地分開。藥物代謝產(chǎn)物的樣品一般先經(jīng)預(yù)處理后用薄層分析，應(yīng)用也很廣，但有時因含量甚微，不用采用氣相和液相色譜法靈敏。
化學(xué)和化工
化工和化學(xué)方面的有機(jī)原料和產(chǎn)品都可用薄層色譜法分析。例如含各種功能基的有機(jī)物，石油產(chǎn)品，塑料單體，橡膠裂解產(chǎn)物，油漆原料，合成洗滌劑等，內(nèi)容非常廣泛。
醫(yī)學(xué)和臨床 薄層色譜法的應(yīng)用還滲透到醫(yī)學(xué)和臨床中去，例如它是一種快速的診斷方法可用于妊娠的早期診斷。方法是基于在孕婦的尿中能檢出比婦女的尿中含更多的孕二醇，把兩者的尿提取后點(diǎn)在薄層上比較，即可作出判斷。這一方法可不用動物而在2~3小時內(nèi)化驗(yàn)出結(jié)果。
毒物分析和法醫(yī)化學(xué)
經(jīng)典的毒物分析有許多缺點(diǎn)，目前毒物分析和法醫(yī)化學(xué)采用薄層色譜法等新的手段。
農(nóng)藥
十多種有機(jī)磷農(nóng)藥和六種有機(jī)氯農(nóng)藥都可在硅膠G薄層上分開并測定含量，可用于農(nóng)藥分析及其殘留量分析。
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